日本海軍は潜水艦に水上偵察機を搭載するというアイデアに真剣に取り組んでおり、１９２０年代の終わりからそのアイデアに沿った水上偵察機の試作をしていた。　１９３４年に大型潜水艦の開発を始めたのに伴い、それに搭載する偵察機の設計を、昭和６年（１９３１）に航空機の製作に乗り出した渡辺鉄工所にその飛行機を設計する機会が与えられた。　渡辺鉄工所はそれまで海軍の航空技術廠の設計になる航空機の製作はしていたが、自分で設計するのは初めてであった。　その結果が複座の小型偵察機E9Wである。　　狭い潜水艦に収容できるように分解、再組み立てが容易にできるよう配慮されていた。　分解に１分半、組み立てに２分半しかかからなかったという。　初飛行は１９３５年、イー５潜水艦での搭載テストが成功裡に終わり、海軍九六式水上偵察機として正式採用された。　試作機の他に３２機が生産され、潜水艦に搭載された。　最終機の生産は１９４０年である。　１９３７年、E14Yに切り替えられることが決定されたが、E9W1は太平洋戦争が勃発した時点でもなお１４機が第一線の潜水艦に配備されていた。 連合軍のコードネームは“スリム”